No Ministério da Ciência, o fervoroso professor Ochanomizu ao lado de seus colegas de trabalho se esforça para reativar o Atom – o primeiro robô com coração humano. Atom é a obra-prima do enigmático Professor Umatarou Tenma, que construiu o andróide para substituir seu falecido filho Tobio. No entanto, enquanto Tenma inexplicavelmente encerrou sua ideia e desapareceu, Ochanomizu se recusa a deixar um avanço tão grande na ciência ser desperdiçado. Apesar de ter a aparência de um menino de nove anos, Atom não só possui uma força e inteligência incríveis, mas também é dotado de uma consciência e compaixão notáveis que rivalizam com os humanos. Infelizmente, o menino mecânico logo enfrenta a rejeição e descobre que nem todos são tão receptivos quanto Ochanomizu. Embora os autômatos tenham se integrado à sociedade, eles são aceitos apenas como ferramentas e até mesmo vistos como uma ameaça iminente ao domínio da humanidade. Sonhando com um mundo onde pessoas e robôs possam prosperar juntos, Atom dedica sua existência a proteger a vida de ambos e inspirá-los a formar laços genuínos. [Escrito por MAL Rewrite]