No ano seguinte à colônia 196, um ano após a conclusão da guerra civil intergaláctica, um estado de estase prevalece sobre a Terra e suas colônias. Não vendo mais uso para seus trajes móveis Gundam, os heróis de guerra Duo Maxwell, Heero Yuy, Trowa Barton e Quatre Raberba Winner decidem destruir essas armas lançando-as na superfície do sol. Antes que os Gundam cheguem ao seu destino, a paz universal é abalada pelo surgimento de Mariemaia Khushrenada - o único filho do ex-aristocrata tirânico Treize. Mariemaia seqüestra a diplomata Relena Peacecraft e anuncia planos de lançar a "Operação Meteoro", com a intenção de cumprir postumamente a trama de dominação mundial de Treize. Com a ajuda do ex-inimigo Zechs Marquise e seu traje móvel Tallgeese, os heróicos pilotos devem readquirir seus trajes móveis para travar uma batalha final contra a dinastia Khushrenada, incluindo a luta contra seu ex-aliado Wufei Chang, agora se alinhando às ambições de Mariemaia. [Escrito por MAL Rewrite]
