A Academia Militar do Império de Barsburg é conhecida por treinar as elites que trazem a vitória ao império. Os estudantes da academia utilizam livremente uma habilidade chamada "Zaiphon" para lutar, enquanto os tipos de Zaiphon utilizáveis dependem da natureza do soldado. Teito Klein, um estudante da academia, é um dos soldados mais promissores produzidos. Embora ridicularizado por todos por ser um escravo (alemão como escravo) sem lembranças de seu passado, ele faz amizade com um colega chamado Mikage. Enquanto se prepara para o exame final, Teito descobre um segredo sombrio relacionado ao seu passado. Quando uma tentativa de assassinar Ayanami, um oficial de alto escalão que matou seu pai, falha, Teito fica trancado aguardando punição. Só querendo o melhor para Teito, Mikage o ajuda a escapar. Teito acaba na Igreja do 7º Distrito, onde é acolhido pelos bispos. É aqui que Teito tenta fugir do domínio de Ayanami e das Forças Armadas, para que ele possa redescobrir suas memórias e aprender por que ele é a pessoa que pode mudar o destino do mundo. [Escrito por MAL Rewrite]
